Dans le domaine de la biologie de la conservation, le 2C2A-CERFE conduit des recherches sur un petit batracien menacé, le Sonneur à ventre jaune, et sur un mustélidé peu connu, la Martre européenne. Ces études visent à évaluer l’impact de la fragmentation de l’habitat sur la conservation des espèces et, dans le cas du Sonneur, à proposer des solutions pour concilier sa conservation et la gestion forestière.

Des recherches ont également été conduites sur les relations entre le Chat forestier et le Chat domestique. Elles ont permis de mieux identifier les éventuelles actions à entreprendre en matière de conservation de l’espèce.

Enfin, les recherches conduites par le 2C2A-CERFE, dans le domaine de l'écologie parasitaire, sur la transmission d'Echinococcus multilocularis dans les populations de renards et de Toxoplasma gondii dans les populations de chats, contribuent à l’élaboration de mesures de prévention des zoonoses dues à ces parasites.